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弓形杆菌:食源性病原基因组揭密

美国农业部农业研究服务处的科学家绘制的Arcobacter butzleri 基因组图谱是控制该食源性病原的第一步。该菌之前被认为是弯曲杆菌家族的一员,现在在农场动物和各种零售肉包括鸡肉、牛肉、猪肉和羔羊肉中已经发现该病菌,其在家禽上具有很高的感染性。

USDA ARS
USDA

如果你饮用或者食用污染称为Arcobacter butzleri 的鲜为人知的微生物的水和食物,该病菌可能会让你致病。

但是农业研究服务处的微生物学家William Miller及其同事已经编译了该细菌的基因序列。科学成果—世界上第一例Arcobacter(弓形杆菌)—可能会加速控制微生物病菌的创新方法出现。


技术员Sharon Horn (已退休)和微生物学家William Miller制备了弯曲杆菌DNA序列自动分析样本。为了更好的理解一个鲜为人知的称为Arcobacter butzleri的微生物,Miller及其同事正将之与相关微生物如弯曲杆菌进行比较。这些比较会发现A. butzler存活策略的线索。

许多医疗人员将A. butzleri 作为食源性疾病出现的病因,据Miller博士认为。以加利福尼亚奥尔巴尼ARS靠近旧金山的西方地区研究中心为基地,他和当地同事以及美国和国外其他同仁进行了基因定序工作。

目标微生物已经被认为是欧洲和东南亚食源性相关疾病爆发的病因。其与一组症状相联系,包括腹泻、胃痉挛、恶心、呕吐和发热-如果未治疗所有这些都是慢性的。

之前,该微生物被认为是一种弯曲杆菌,弯曲杆菌是细菌性腹泻的世界顶级病因。后来,A. butzleri 被归类到弓形菌类。

现在,通过将A. butzleri与其他微生物的基因组成进行比较,Miller博士及其合作研究人员了解了更多该病菌与其他微生物的相关性。这种比较是很重要的:他们可能得出A. butzleri的存活策略线索且对之前科学家用来保持食物和水安全的未知弱点更重要。

A. butzleri没有作出这种简单的比较。

该团队的分析已经表明许多 A. butzleri 基因与其他微生物的基因“似乎不相配”,Miller博士说。他的观察基于将 A. butzleri 基因序列与全球资讯网上公布的其他序列相比较。

“我们不知道这些特有的A. butzleri 基因是干什么的,”Miller博士解释。“这是该病原如此有趣的原因之一。”

当研究发现所有A. butzleri的基因功能继续,Miller博士已经使用该基因数据开发众所周知 的“分类方法”。在追踪食源性疾病爆发源时,医疗人员、公共健康够和研究人员可使用它。

基于众所周知的“多位基因座序列”技术,试验将A. butzleri 从几个可能是爆发病菌称为A. cibarius、A. cryaerophilius 和 A. skirrowii的同胞中区别出来。而且分类方法不只是区别这些品种:它也是“每个品种精确而不含糊的指纹株,”Miller博士指出。“这使得其在研究爆发源上尤其有用。”

其他科学家正在使用新的试验,Miller博士说。他预计他的有关试验文章今年会发表。他的关于测定完整A. butzleri 的基因序列的文章发表在2007年在线杂志PloS ONE上。

2009年4月

2010年 9月 3日 星期五