专题文章
2009年CODA-CERVA 分析的沙门氏菌血清型
比利时联邦畜牧和农业化学研究中心（CODA-CERVA）已经发表了2009年分析的沙门氏菌血清型，比较了家禽、牛和猪在1998至2009年期间的分离株，以及抗生素抗性检测结果。
CODA–CERVA的普通与分子细菌学实验室是比利时沙门氏菌、动物健康参考实验室。
所有的沙门氏菌均按照官方卫生程序获取，在CODA-CERVA进行分析。在2009年，联邦食品链安全机构在种禽、产蛋鸡和屠宰前肉鸡上组织了方案。在动物生产上没有欧洲协调监控方案。此外，从食源性动物、伴侣动物或其他动物上分离的大多数沙门氏菌或者在野外研究期间获得的株系均被送到参考实验室进行血清学分类。
实验室方法
所有送到CODA-CERVA进行沙门氏菌分离株以及给沙门氏菌分类的株系都按照实验室管理信息系统（LIMS）进行常规编码。接着，所得分析结果都存入同一数据库。关于沙门氏菌分离株、血清分类以及本文件列出的抗生素抗性的信息都摘自2009年结束的LIMS文件。
CODA-CERVA的沙门氏菌分离株是基于ISO6579:2002完成。沙门氏菌分离株遵照Kauffmann-White方法进行血清分类。
在许多情况下，株系均被寄到布鲁塞尔的公众健康科学院，它是国家公众健康沙门氏菌和志贺氏菌属的参考中心。在CODA-CERVA的分离和血清分类以及在在IPH的血清分类都是在Belac评审条件（ISO 17025）下完成的。
通过平板扩散药敏试验进行药敏测试，使用Neo-Sensitabs (Rosco)纸片。按照生产商指导使用CLSI所述方法进行试验和说明。用质量对照菌株E. coli ATCC25922进行内部对照。当与QC菌株的结果是在Rosco提议的限制内此结果方可接受。
2009年沙门氏菌分离株的结果
2009年分析了71个沙门氏菌分离株，与2008年基本一样（n=74）。大多样本来自污水（n=27）、饲料（n=15）或牛和家禽（均为13个）。
沙门氏菌血清分类结果
在2009年，将2132株沙门氏菌进行了分类，比前一年少大约13%。分离的菌株属于58个不同的血清型和6个血清群（不完全抗原表达；群B、C1-C4、D1、D2、E1-E2-E3、E4）。
大多数沙门氏菌菌株源自家禽（53.6%）和猪（25.1%）。其他分离株来自饲料（6.1%）、牛（3.8%），各种鸟，包括鸽子、野鸡和火鸡（3.0%）、肥料（9个株系）以及来自废水纯化的沉积物（7个株系）。还有132个分离株来源不详。
在所分析的分离株中鼠伤寒沙门氏菌（S. Typhimurium）血清型（22.7%）[62.7%传统变体O5+和37.3% 的Copenhagen变体O5+]，肠炎沙门氏菌（S. Enteritidis ）血清型（14.9%）和乙型副伤寒沙门菌（S. Paratyphi B ）血清型（11.4%）[98.0%为酒石酸阳性或var. Java]非常多。相比禽和猪S. Typhimurium分离株，其中大约60-70%属于传统变异体O5+，来自牛的S. Typhimurium同样属于传统变体O5+和Copenhagen变体O5-。尤其在猪上，以及在家禽上发现了单相沙门氏菌4:i:-（分别为17和4个分离株）。在家禽上，鉴别出一些沙门氏菌4:-:2变体以及一些不动的O4:-:-变体。
其他流行的血清型包括姆班达卡沙门氏菌（S. Mbandaka ）（4.5%），婴儿沙门氏菌（S. Infantis ）（4.1%），B组沙门氏菌（S. Group B ）（3.7%）和德尔卑沙门氏菌（S. Derby ）（3.5%）。相比2008年，副伤寒B（S. Paratyphi B ）和S. Mbandaka 血清型的比例大幅增加（2008年比例分别为3.6%和1.5%），而S. Derby 呈下降趋势（2008年6.9%）。
家禽分离株
总之，在2009年分析了1142个家禽沙门氏菌株系，比2008年多20%。
肠炎沙门氏菌（S. Enteritidis ）的比例（27.6%；2008年为36.0%）和S. Typhimurium（6.7%，2009年9.3%）明显降低，而S. Paratyphi B （2009年和2008年分别为20.2%和8.8%）显著增加。对其他血清型也进行了分类，如S. Mbandaka （2008年为2.4%；2009年为4.0%）、阿贡纳沙门氏菌（S. Agona）（2008年为2.7 %；2009年为3.9 %）和S. Livingstone（2008年为2.4 %；2009年为3.9 %）.
631个沙门氏菌家禽分离株来源已知更详细。34个菌株来自种禽，其中9、7和5个分离株分别属于Senftenberg、鼠伤寒和Hadar型。产蛋鸡分离株(n=122)主要是S. Enteritidis（59.0%），还发现婴儿、鼠伤寒和Livingstone血清型（均为4.1%）。在2009年分类一株鸡伤寒沙门氏菌（S. Gallinarum）。肉鸡分离株(n=192)主要是S. Paratyphi B（32.3%），还经常鉴别出Hadar（9.9%）、Agona（7.8%）、Minnesota（5.7%）和Virchow（5.7%）。最后，淘汰母鸡（n=283）的分离株通常属于S. Enteritidis（66.8%）和S. Paratyphi B（6.7%）。
牛分离株
相比2008年（n=112），牛上的分离株数量已下降（n=81）。最常发现的血清型为都柏林（Dublin）（58.0%），接着鼠伤寒血清型（33.3%），其数字与2008年完全一致。
猪分离株
在2009年检测的猪菌株数量缩回至2007年的数量（2009、2008和2007年分别为n=536、1017和481）。发现了更多的S. Typhimurium分离株（63.8；2008年为48.5%），而S. Derby与2008年等比例（13.4%；2008年为15.6%）。9%的猪菌株都只是部分分型，且属于B组沙门氏菌。
鸟分离株
鸟的分离株来自野鸡、鸽子和火鸡。对来自野鸡的一株S. Gallinarum进行了分型。
所有分析的鸽子株系都鉴别为S. Typhimurium变体Copenhagen，这在这些鸟上很常见。
其他分离株
对有限的食品分离株（n=17）进行了分析。其中7个为S. Paratyphi B，且其中6个，与家禽有很明显的联系。
关于饲料，50个菌株是动物源性的；16%的沙门氏菌属于S. Montevideo、14%属于em>S. Livingstone以及10%的em>S. Paratyphi B。将3株S. Typhimurium进行了分型，以及一株S. Enteritidis和一株S. Infantis进行了分型。26个源自植物源（主要是大豆）的分离株主要是S. Agona 和S. Anatum。没有发现S. Enteritidis和 S. Typhimurium。
来自肥料的菌株几乎一半（9个分离株中的4个）为S. Senftenberg。来自废水纯化沉积物中的沙门氏菌属于7种血清型，其中一株S. Infantis和一株S. Typhimurium。
1997-2008年在CODA-CERVA分析的沙门氏菌菌株的进化
研究了最常见的家禽、牛和猪血清型在过去12年期间的进化。为了比较，将早些年分析的沙门氏菌血清型列在附录中。
每年送至NRL的家禽分离株的数量是在700-1500间变化。在2009年，几乎三分之一的家禽株系属于肠炎血清型，这比2008年和2007年少。鼠伤寒菌株的比例自2001年以来低于10%并在2009年达到6.7%。副伤寒菌株的比例，在2006年达到高峰后，在最近几年下降但是在2009年又再次达到20%。在2009年，Hadar、Infantis和Virchow血清型大约为家禽分离株的2-3%。
在牛上，自2002年以来S. Dublin一直为主要的血清型，且在牛菌株中达到60%的比例。S. Typhimurium（大约30%）为第二大重要的。
在猪分离株中，S. Typhimurium仍然是最流行的血清型，占猪沙门氏菌60%以上。Derby血清型是第二大重要的血清型，占菌株13%的比例。
在选择的沙门氏菌血清型中的抗生素抗性研究
在2009年对1128个沙门氏菌分离株进行了药敏试验。为了降低由于在同一采样时间且属于同一血清型的来自同样来源的多个株系带来的偏差，每个血清以及每个来源只选择一个分离株进行药敏试验。因此，株系之间是相互独立的。所用的抗生素为氨苄青霉素（Ap）、头孢噻呋（Cef）、链霉素（Sm）、新霉素（Ne）、庆大霉素（Gm）、四环素（Tc）、磺胺（Su）、甲氧苄啶磺胺（TSu）、萘啶酸（Nal），恩诺沙星（Enr），氯霉素（Cm），氟苯尼考（Ff）。列出了分离株的数量、血清型及其来源。
共613株沙门氏菌分离株（54.3%）对所有受试抗生素药物全部敏感。在2008年，62.6%的株系是敏感的，这可能是由于2009年受试S. Enteritidis株系比例较少的缘故。抗性主要发现为抗Ap (37.6%)、Su (32.1%)、Tc (28.2%)、St (23.9%)以及TSu (21.8%)。值得注意的是，抗Nal（13.3%）和头孢霉素（7.1%），均大大高于2008年（8.7%和3.0%）。抗Ne、Gm和Enr（均0.4%）以及Cm和Ff（7.6%和3.5%）与2008年相似。
试验发现来自家禽的沙门氏菌株系（34.0%）比来自猪和牛的株系（79.0%和71.5%）抗性低。在牛和猪株系中抗Ap、St、Tc、Su、Tsu、Cm和Ff相比家禽的分离株都较高。另一方面，11.0%的家禽分离株是抗Cef的，而猪和牛的株系分别为4.5%和1.8%。20%的家禽沙门氏菌是抗Nal，但是几乎不抗Enr（0.3%）。
大多数S. Agona分离株（家禽n=48; 32）对所有受试抗生素药物全部敏感。试验发现大多数抗性是抗Ap和Su（均为14.6%）。
只有7株S. Blockley分离株，均来自家禽，进行了试验，且都具有抗Ap Tc Su Tsu Nal图谱。
60%以上的S. Derby分离株（n=26；主要来自猪）是敏感的（61.5%），虽然发现有些抗Su（26.9%）、St和Tc（23.1%）。
关于 S. Dublin分离株（n=20；主要来自牛），其中半数是完全敏感的。S. Enteritidis分离株(n=115)是主要敏感的（96.5%）。来自家禽的只有一个分离株表现抗Ap St Tc图谱。
对21%的S. Hadar株系进行了试验且只有一株（来自家禽）发现是敏感的。抗性图谱Ap Tc Nal和Tc Nal是最经常表现的（分别为45.5%和40.9%）。
所有17株S. Indiana为多抗性的，其中16个表现抗Ap St Su Tsu图谱。
大多数S. Infantis株系是敏感的（89.4%）。两株抗Cef。大约60%的S. Mbandaka分离株（n=48）对所有受试抗生素敏感。10株表现抗Ap Su Tsu图谱是抗Cef的。
21株S. Minnesota分离株中16株是敏感的，但是4株具有Ap Cef Su Tsu图谱。
只有5.1%的S. Paratyphi B (n=78)株系his完全敏感的。最多的是抗Ap Nal图谱(69.2%)。几乎一半株系是抗Cef的。
对有限数量的S. Regent株系进行了试验（n=14），且只有一个分离株表现抗Ap和Nal。没有鉴定出敏感分离株。
发现只有23.9%的S. Typhimurium分离株（n=289）是敏感的。17.3%的分离株为Penta-抗性Ap St Tc Su。11.4%的分离株抗Ff，以及2.4%的S. Typhimurium抗Cef。
大约四分之三的S. Virchow分离株(n=13)对所有受试抗生素有抗性。在前几年，最常见的抗性发现是抗Ap (69.2%)和Nal (53.8%)。Cef 抗性明显高：38.5%。
还对属于其他血清型的菌株进行了测试。大多数这些分离株都对所有受试抗生素完全敏感。
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2010年9月
